生物信息學(xué)章節(jié)練習(xí)(2020.05.17)

來源：考試資料網(wǎng)

1.名詞解釋空位罰分

參考答案：空位罰分是為了補償插入和缺失對序列相似性的影響，序列中的空位的引入不代表真正的進化事件，所以要對其進行罰分，空位罰分的多...

2.填空題蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)搜索工具：（）

3.名詞解釋最大似然法（ML）

參考答案：它對每個可能的進化位點分配一個概率，然后綜合所有位點，找到概率最大的進化樹。最大似然法允許采用不同的進化模型對變異進行分...

4.問答題MEGA2如何將其它多序列比對格式文件轉(zhuǎn)化為MEGE格式的多序列比對文件？

參考答案：（1）選擇菜單file，
（2）選擇Text File Editor and Format Coverter工...

5.問答題在序列比對時DNA序列和蛋白質(zhì)序列得分矩陣的意義有何不同？

參考答案：核酸序列得分系統(tǒng)比較簡單，只需要考慮匹配、不匹配及空位罰分這三種情況；而蛋白序列比對就要復(fù)雜得多，除了考慮匹配和空位罰分...

6.名詞解釋標度樹

指分支長度和相鄰節(jié)點對之間的差異成比例的系統(tǒng)發(fā)生樹。

7.名詞解釋極性鍵

在一個帶全正電的分子和另一個帶全負電的分子之間發(fā)生的相互作用。

8.問答題簡述構(gòu)建進化樹的步驟，每一步列舉1-2種使用的軟件或統(tǒng)計學(xué)方法。

參考答案：（1）多序列比對：ClustalW
（2）校對比對結(jié)果：BIOEDIT
（3）建樹：MEGA ...

9.名詞解釋模塊替換矩陣（BLUSUM）

在替換矩陣中，每個位置的打分是在相關(guān)蛋白局部比對模塊中觀察到的替換的頻率而獲得的，每個矩陣被修改成一個特殊的進化距離。

10.名詞解釋二級結(jié)構(gòu)

指源自蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的α螺旋、β折疊等局部結(jié)構(gòu)特征。