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生物信息學(xué)章節(jié)練習(xí)(2020.06.08)

填空題
常用的三種序列格式：（）
答案：NBRF/PIR，F(xiàn)ASTA和GDE
多項(xiàng)選擇題
下面序列哪些為反向重復(fù)序列（）
A.…GCACTTG…GCACTTG…
B.…GCACTTGCAAGTGC…；…CGTGAAC…CGTGAAC…；…CGTGAACGTTCACG…
C.…GCACTTG…CAAGTGC…
D.…GCACTAGCTAGCGG…；…CGTGAAC…GTTCACG…；…CGTGATCGATCGCC…
問答題
試述SWISS-PROT中的數(shù)據(jù)來源。
答案：（1）從核酸數(shù)據(jù)庫經(jīng)過翻譯推導(dǎo)而來；
（2）從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫PIR挑選出合適的數(shù)據(jù)；
（3）從科學(xué)...
名詞解釋
分子鐘
答案：認(rèn)為在進(jìn)化過程中物種間分子進(jìn)化速率是恒定的或者幾乎不變的假說，即蛋白序列間的氨基酸替換數(shù)正比于序列間的分歧世代數(shù)。意義：...
名詞解釋
序列表譜（profile）
答案：
是一種特殊位點(diǎn)或模體序列，在多序列比較的基礎(chǔ)上，氨基酸的權(quán)值和空位罰分的表格。
問答題
BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途什么？
答案：blastn是將給定的核酸序列與核酸數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行比較；Blastp是使用蛋白質(zhì)序列與蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行比較，...
問答題
簡(jiǎn)述DNA計(jì)算實(shí)現(xiàn)方式中，表面方式與試管方式相比具有哪些優(yōu)點(diǎn)？
答案：試管方式：就是在一個(gè)或多個(gè)試管的溶液里進(jìn)行生化反應(yīng)；
表面方式：是將對(duì)應(yīng)的解空間的DNA分子固定在一塊固體上，...
名詞解釋
GenPept
答案：是由GenBank中的DNA序列翻譯得到的蛋白質(zhì)序列。數(shù)據(jù)量很大，且隨核酸序列數(shù)據(jù)庫的更新而更新，但它們均是由核酸序列翻...
單項(xiàng)選擇題
在真核生物中，一個(gè)基因cDNA的5′端起始密碼子AUG的前后序列符合（）規(guī)則。
A.Kozak
B.AU…AG
C.SD
D.Poly（A）n
名詞解釋
無根樹（unrooted tree）
答案：只表明節(jié)點(diǎn)間的關(guān)系，無進(jìn)化發(fā)生方向的信息，通過引用外群或外部參照物種，可以在無根樹中指派跟節(jié)點(diǎn)。（一種系統(tǒng)發(fā)育樹，所有在...

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